Od začetka pandemije ima diagnostično testiranje ključno vlogo pri nadzoru širjenja SARS-CoV-2, virusa, ki povzročaCOVID 19.Hitri antigenski testiki se izvajajo doma ali v kliničnem okolju, zagotavljajo rezultate v 15 minutah ali manj.Prej ko je oseba diagnosticirana, prej lahko poišče zdravniško pomoč in se izolira od drugih.Toda ko se pojavijo nove različice virusa, teh različic morda ne bodo odkrili ti testi.
Večina hitrih antigenskih testov je zasnovanih za odkrivanje nukleokapsidnega proteina SARS-CoV-2 ali N-proteina.Te beljakovine najdemo v izobilju v virusnih delcih in okuženih ljudeh.Hitri testni kompletobičajno vsebujejo dve različni diagnostični protitelesi, ki se vežeta na različne dele proteina N.Ko se protitelo veže na protein N v vzorcu, se na testnem kompletu pojavi barvna črta ali drug signal, ki kaže na okužbo.
Protein N je sestavljen iz 419 aminokislinskih strukturnih enot.Vsako izmed njih lahko z mutacijo nadomestimo z drugo aminokislino.Raziskovalna skupina pod vodstvom dr.Philip Frank in Eric Ortlund z univerze Emory sta se odločila raziskati, kako ta sprememba posamezne aminokisline vpliva na učinkovitost hitrega antigenskega testa.Uporabili so tehniko, imenovano globoko skeniranje mutacij, da bi hkrati ocenili, kako vsaka mutacija v proteinu N virusa vpliva na vezavo na diagnostično protitelo.Njihovi rezultati so bili objavljeni v Cell 15. septembra 2022.
Raziskovalci so ustvarili obsežno knjižnico skoraj 8000 mutacij beljakovin N.Te različice predstavljajo več kot 99,5 % vseh možnih mutacij.Nato so ocenili, kako je vsaka različica vplivala na 17 različnih diagnostičnih protiteles, uporabljenih v 11 komercialno dostopnih hitrih antigenskih testih, vključno s pogostimidomači kompleti.
Ekipa je ocenila, katere mutacije N-proteina vplivajo na prepoznavanje protiteles.Na podlagi teh informacij so ustvarili "profil ubežne mutacije" za vsako diagnostično protitelo.Ta profil identificira specifične mutacije v proteinu N, ki lahko vplivajo na sposobnost protitelesa, da se veže na svojo tarčo.Analiza je pokazala, da protitelesa, uporabljena v današnjih hitrih testih, prepoznajo in vežejo vse pretekle in sedanje različice SARS-CoV-2, ki vzbujajo skrb in skrb.
Čeprav več diagnostičnih protiteles prepozna isto regijo proteina N, so raziskovalci ugotovili, da ima vsako protitelo edinstven podpis ubežnih mutacij.Ker virus SARS-CoV-2 še naprej mutira in ustvarja nove različice, se lahko ti podatki uporabijo za označevanje protiteles v kompletu za testiranje, ki jih bo morda treba ponovno oceniti.
"Natančna in učinkovita identifikacija okuženih posameznikov ostaja kritična strategija za ublažitev COVID-19, naša študija pa zagotavlja informacije o prihodnjih mutacijah SARS-CoV-2, ki bi lahko motile odkrivanje," je dejal Ortlund."Tukaj opisani rezultati nam omogočajo, da se hitro prilagodimo temu virusu, saj se še naprej pojavljajo nove različice, ki predstavljajo takojšnje klinične posledice in posledice za javno zdravje."
Ozadje: Globoko skeniranje mutacij zazna ubežne mutacije v nukleokapsidi SARS-CoV-2 s trenutno razpoložljivimi hitrimi antigenskimi testi.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, celica Ortlund EA.15. september 2022; 185 (19): 3603-3616.e13.Ministrstvo za notranje zadeve: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29. avgust 2022 PMID: 36084631.
Financiranje: Nacionalni inštitut za biomedicinsko slikanje in bioinženiring NIH (NIBIB), Nacionalni inštitut za diabetes, prebavne in ledvične bolezni (NIDDK) in Nacionalni inštitut za alergije in nalezljive bolezni (NIAID), Ameriško združenje za srce.
NIH Research Matters je tedenska posodobitev ključnih ugotovitev raziskav NIH, ki so jih pregledali strokovnjaki NIH.Objavlja ga Urad za komuniciranje in odnose z javnostmi direktorja Nacionalnega inštituta za zdravje.